V ne tako oddaljeni prihodnosti Zemljo napadejo Nezemljani. Velemesta so zapuščena, prebivalstvo zdesetkano, nezemljska bitja vladajo planetu. Ostala je le peščica ljudi, ki mora najti način za preživetje invazije in ponovno prevzeti oblast na planetu. Dva med preživelimi, Aki Ross (glas Ming-Na) in njen mentor, dr. Sid (glas Donald Sutherland), sta odločena razmišljati drugače. Razvijata organsko rešitev, čeprav večina meni, da bi se reševanja problema morala lotiti izključno vojska. Izhajajoč iz svoje valovne teorije Sid razvija protistrup, ki bi kljuboval nezemeljski sili. Z Aki sta prepričana, da vse oblike življenja zaznamujejo posebni duhovni valovi, ki jih je moč identificirati in ujeti.